完成三之岛树果森林解救小迷的任务后，你的首要步骤是返回之前的岛屿交付任务并获取关键奖励。你需要从三之岛的港口乘船，返回二之岛找到小迷的父亲，将陨石交还给他以换取月之石作为奖励。你需要再次乘船前往一之岛，与正在那里等待的正辉会合。这一系列行动标志着七岛剧情中段任务的正式完结，接下来你的冒险重心将转回关都地区的主线。从岛屿返回关都大陆最直接的方法是使用宝可梦的飞行技能，如果你的队伍中有已学会飞行的宝可梦，可以随时打开地图快速传送到任何去过的城镇；如果你尚未掌握飞行，或者希望体验完整流程，则需在码头与船员对话，选择前往一之岛或二之岛的船只，记得随身携带船票。
与正辉会面后，游戏的主线剧情将指引你返回红莲岛，继续挑战关都地区的剩余道馆，并为通往宝可梦联盟的冠军之路做准备。七岛之旅主要是一个穿插在主线中的支线剧情，让你获取重要道具并解锁特定区域，在完成三之岛任务后，你的下一个核心目标通常是收集齐八枚道馆徽章。在离开岛屿前，建议你在宝可梦中心进行充分的队伍补给与状态恢复，整理背包中的技能机器和关键道具，例如确保秘传技能如冲浪、怪力等已分配给合适的宝可梦携带，以应对后续地图的复杂地形。
在彻底离开三之岛区域前，如果你在之前的探索中有遗漏，可以考虑进行最后的查漏补缺。三之岛本身拥有如绊桥和树果森林等可供探索的区域，这些地方分布着一些道具和野生宝可梦。树果森林内种植着多种不同的树果，而绊桥上也安排了数位训练师等待对战。确保你已经探索了这些区域的隐藏路径，它们有时会放置稀有道具。检查你是否已经完成了诸如唤醒并收服或击败挡路的卡比兽等前置任务，这些障碍的清除对于后续在关都地区的自由行动至关重要。
它意味着一个阶段性目标的达成，并为你返回关都地区挑战联盟铺平了道路。妥善交还任务物品并获取奖励后，你的旅程将重新聚焦于成为冠军的最终目标。接下来的挑战会更加严峻，包括挑战剩余的道馆馆主、穿越冠军之路的复杂迷宫，最终在宝可梦联盟中与四天王及冠军对决。请确保你的主力宝可梦等级足够，并携带充足的恢复类药品。完成联盟挑战后，游戏可能还会解锁前往更多后续岛屿的剧情，开启二周目或更多的探索内容。
